請準備自然人憑證IC卡和讀卡機，並於電腦安裝讀卡機元件。在行動自然人憑證(TW FidO)網址https://fido.moi.gov.tw/登入會員後，點選網站右上角的"裝置資訊/停復用"，在裝置資訊中"裝置功能"欄位，點選"註銷憑證"，即可取消綁定您欲取消的裝置。
是，目前只規劃支援可使用生物辨識的手機，且必須於裝置內設定您的生物特徵（指紋或臉部）方能進行使用。建議手機作業系統版本Android 7.0以上、iOS 14.0以上。
行動自然人憑證(TW FidO)為提供安全且便利的登入方式，以生物特徵辨識(如指紋或臉部感應)讓民眾可以利用自然人憑證註冊完後綁定手機，即可免去登打密碼的步驟，就能用身分識別的功能登入多項政府提供的服務，例如可登入使用mydata、申報綜合所得稅、繳納地價稅等，服務會陸續增加。
iOS的用戶可以至APP sStore，Android用戶可以至Google 商店搜尋以下關鍵字，如:行動自然人憑證、TW FidO，即可下載安裝。
指紋為儲存於個人行動裝置內，因此以使用者綁定之行動裝置設定為主，如已經將行動裝置上建立的指紋移除，便無法透過本服務進行身分識別或憑證簽章，另外如果行動裝置損壞或更換，尚未在新的行動裝置上建立指紋，也無法使用本服務。
否，註冊或驗證服務(無論指紋或臉部)會依照使用者手機本身的裝置設定，以及您已經建立的生物特徵來判斷，若您建立於手機的是拇指，必須以拇指驗證才會通過。假設您持有的是iPhone X，只能用臉部辨識登入，無法使用指紋辨識。
本系統預設都是採用指紋辨識，除了某些作業系統為iOS且只能用臉部辨識去做螢幕解鎖的機型(如:iPhone X、XR、XS、11、12、13)，本系統才有針對此類型的裝置可使用臉部辨識功能去做身分驗證。
如果此手機設定的指紋為你本人，對方無法用你的手機去做身分驗證登入。建議先將手機恢復原廠設定再轉給其他人使用，較能保障您的資訊安全，或至網站上取消綁定您的行動裝置，並將行動自然人憑證(TW FidO)APP移除。當APP移除重裝時，必須重新綁定才能使用。
可先查看行動自然人憑證(TW FidO)APP是否有開啟允許接收推播通知的設定，部分中國品牌手機因有推播訊息會被阻擋的原因，無法接收Google來源之推播訊息，民眾可詢問各家廠牌客服中心，如何設定允許接收Google推播通知，方可使用接收推播訊息的方式登入系統。
因本系統是取您行動裝置上所建置的生物特徵值(指紋或臉部)去執行身分驗證的服務，註冊綁定後您的行動裝置有變更過生物特徵設定，系統內存有金鑰保護機制，需要請您移除APP後，重新安裝與註冊綁定，即可使用本系統。
目前本服務只能在臺灣地區下載。
行動自然人憑證(TW FidO)的註冊及驗證，都必須使用儲存於行動裝置內的生物特徵資料，行動裝置上建立指紋未完成之前，則無法使用本服務，只要重新在您的行動裝置中建立指紋，並且重新綁定即可使用。
目前每個使用者限制只能綁2隻行動裝置。
現階段是沒有開放臨櫃申辦。
請確定安裝讀卡機元件完成後，是否有重新啟動電腦，及確認電腦桌面點左下”開始”>”跨平台網頁元件”>”啟動元件服務”>進行元件偵錯，若未出現”跨平台元件已在執行中”表示元件安裝過程不順利，需轉諮詢自然人憑證客服0800-080-117。
"1、符合線上續卡資格的憑證用戶，請至內政部憑證管理中心官網https://moica.nat.gov.tw/index.html進入憑證作業/線上續卡申請，使用符合線上續卡資格的自然人憑證IC卡登入後，點選自然人憑證線上續卡，依照說明輸入申請資料。並以ATM轉帳或信用卡完成繳費。 2、繳費成功後，系統會寄送「線上申請續卡已繳費」通知信函，至用戶申請時填寫的E-MAIL信箱，即代表申請完成。"
請至內政證憑證管理中心官網https://moica.nat.gov.tw/index.html進入憑證作業/線上續卡開卡，輸入申請線上續卡時自行設定的用戶代碼即可完成開卡作業。