行政院農業委員會正研擬修正農會法部分條文修正草案，邀集內政部、財政部賦稅署、各縣市政府及農會界等共召開3次會議，其中涉及農會組織區域及層級之修正重點為99年12月25日縣市改制為直轄市後，轄下原直轄市農會、縣(市)農會，應於改制後1年內自行或由主管機關協調分別變更為直轄市農會及區農會，或合併成為一個直轄市農會，至基層農會之組織區域則以尊重農會意願，不採強制合併為原則。農會法部分條文修正草案行政院已於99年10月12日函請立法院審查。