為端正選風，內政部遵行政院長林全指示，就106年各級農、漁會改選，要求各警察機關確實依「106年農漁會選舉查察原則」，加強宣導及辦理查察賄選工作；內政部長葉俊榮並指示警政署針對此次農漁會選舉應全面淨化選前治安環境，秉持一貫嚴密查察及防制暴力介入原則，積極主動偵辦，如查有實證，更應加速偵查，以收遏阻效力。
各直轄市、縣（市）政府主管機關將在2月19日先辦理各級農會改選工作，各警察機關將投入5,254名警力，並另規劃緊急事故處理小組3,319名。目前各警察機關已全面啟動農、漁會選舉查賄制暴工作，進行情資蒐報及風險評估，將風險區分為三個等級，其中發生賄選、暴力案件高度風險之紅燈區域共21區，中度風險之黃燈區域共49區，其餘區域為綠燈，針對紅燈及黃燈區域將加強勤務部署及情資蒐報，積極偵辦；並要求轄區分局加強聯繫轄內農、漁會候選人，以維護社會治安。另為防制組織幫派介入本次選舉，內政部警政署已啟動農、漁會選舉掃黑工作，以「立即反應、即時壓制」、「事後深入追查、向上追究首謀」及「連坐檢肅成員，切斷金流源頭」方式，貫徹掃黑三打策略，防制幫派介入選舉。
截至2月18日，全國警察機關受理賄選及暴力情資案，在農會選舉部分，計74件（其中賄選案件有64件、暴力案件有10件）；在漁會選舉部分，計8件（其中賄選案件有6件、暴力案件有2件），總計共82件，其中已報請各地方法院檢察署指揮偵辦者有36件，鎖定犯罪嫌疑人達數百人。目前已有具體查獲成果，賄選及暴力介入選舉之案件共已經查獲13件107人。
各級漁會將於3月18日進行改選，內政部持續要求各警察機關強力掃蕩組織幫派及偵防暴力犯罪，並嚴密查察賄選案件，針對已偵破賄選案件，循金流來源，積極配合檢察機關深入追查幕後金主及共犯組織結構，有效推動查賄制暴相關工作，以達到淨化選風之目標。