有關媒體報導「內政部地震補助，首納透天厝及農舍，被質疑大撒幣」，內政部指出，918地震造成東臺灣多處建築物毀損，考量花東受災地區大多位在非都市土地，且多數為單棟透天住宅，如因地震且經建築物安全評估後，被張貼紅、黃單，同時有確實居住事實者，政府應主動從寬認定予以協助補助，本次建築師公會及土木技師公會等民間團體，也將協助緊急評估、耐震評估及補強一併辦理，提供一條龍服務，讓受災民眾儘速回復正常生活。
經費足夠 中央、地方應齊心合作，加速完成災後復原工作
內政部表示，截至9月29日止共有紅單73件(花蓮46件、臺東27件)及黃單61件(花蓮51件、臺東10件)。本次將透天厝納入建物補強補助對象，並以紅黃單受災住宅為主，對於無保存登記，但能證明有實際居住使用的建物，採放寬認定，每件可補助50萬，以符合民眾就地震受損的結構、基礎進行復原及修繕的需求，讓房屋儘早完成修復及回歸居住使用。
另內政部次長花敬群昨(29)日已率營建署同仁實際至花東勘災，並向民眾說明已啟動房屋受損民眾租金補貼、重建、重購或修繕貸款及耐震評估補強補助等各項協助措施，後續補助的發放也將採從寬認定。另針對媒體報導50萬補助不足部分，內政部強調，現勘時已與民眾及地方鄉鎮長說明，其均表達感謝政府協助，且補助足夠讓民眾加速恢復家園。
內政部最後表示，未來也請地方政府從寬認定，並期盼地方政府能齊心投入災後復原工作，少一點政治操作，才可讓花蓮、臺東能早日完成重建。